Struktura BHMW
- Szef Biura
- Zastępca Szefa Biura
- Oddział Hydrograficzny
- Oddział Informacji Nautycznej
- Oddział Kartografii Morskiej
- Oddział Oceanograficzno-Meteorologiczny
- Wydział Logistyki
- Wydział Organizacji dodatkowo Planowania
- Wydział Zabezpieczenia
- Pion Głównego Księgowego